Diagnostisk analys för Shigella: Identifiering och epidemiologisk typning
(art nr 1057)
Indikation:
Att särskilja Shigella och Escherichia coli som har en mycket hög DNA/DNA homologi och strikt taxonomiskt hör till samma art från varandra. För att kunna skilja dessa ”arter” åt krävs agglutination i specifika antiserum som flertalet laboratorier saknar som även ger en viss epidemiologisk information.
Provmaterial:
Renkultur av misstänkt Shigella skickat på ett av SMI tillhandahållet transportsubstrat. Isolatet sparas i frys.
Analysmetod:
Insända isolat karakteriseras med en biokemisk testpanel samt agglutineras i monospecifika antisera mot O-antigener.
E. coli isolat som har samma virulensplasmid som Shigella besvaras som EntreroInvasiva Escherichia coli (EIEC). Närvaro av virulensplasmiden påvisas enklast med polymerase-chain reaction (PCR).
Svar/Tolkning:
Svaret anger om stammen är identifierad som Shigella, som EIEC (PCR positiv för virulensplasmiden) eller som negativt för Shigella.
Minimikriterier:
Stam som agglutinerar som en känd serotyp och som i den biokemiska karaktäriseringen jäser som Shigella besvaras som Shigella med angivande av serotyp.
Stam som i renkultur inte jäser som Shigella besvaras: Negativt för Shigella.
Stam som jäser som Shigella och är PCR positiv för virulensplasmiden men inte agglutinerar i antisera besvaras: EIEC.
Vid oklara resultat kan isolatet sändas till Laboratory of Enteric Pathogens vid HPA i England för bedömning.
Det utskrivna svaret kontrolleras med avseende på att patientuppgifter, insändare och svar är korrekt och signeras. Svaren läggs i kuvert vilka sänds till insändande laboratorium.
Kontakt:
Provsvar: 08-457 2416
Medicinskt ansvarig: 08-457 2415
Metodfrågor: 08-457 2416
Priser:
För aktuella priser hänvisar vi till publikationen Prislista för speciell diagnostik som finns att ladda ner på SMI:s webbplats.
Packa provet rätt:
För praktisk handledning inför transport av prov inom Sverige hänvisar vi till publikationen Packa provet rätt som finns att ladda ner på SMI:s webbplats.
Beställning av remiss:
Beställ/ladda ner SMI:s remiss
Referenser
Ewing. 1986. Identification of Enterobacteriaceae. Elsevier Press.
Farmer III et. al. 1985. Biochemical Identification of New Species and Biogroups of Enterobacteriaceae. J. Clin. Microbiol. 21:46-76.
Uppdaterad 2007-01-04 10:04