Diagnostisk analys för Mycobacterium tuberculosis: epidemiologisk typning
(art nr 1054)
Indikation:
Epidemiologisk typning för smittspårning. Identifiering av laboratoriekontamination.
Provmaterial:
väl utvuxen renkultur (Löwenstein Jensen medium) av identifierad Mycobacterium tuberculosis komplex stam.
Analysmetod:
Den typning som görs vid SMI förutsätter att stammen är identifierad som tillhörande M. tuberculosis komplexet.
Typning sker med sk restriction fragment length polymorphism (RFLP). RFLP är ackrediterad metod, och internationell validerad. Då stammen uppvisar ett RFLP mönster med färre än fem band utförs även spoligotypning.
Svar/Tolkning:
Resultat av RFLP redovisas i form av grad av identitet mellan jämförda isolat:
- 100% identitet: Tillhör ett gemensamt kluster. Troligt epidemiologiskt samband.
- >90% identitet: Epidemiologiskt samband kan inte uteslutas.
- <90% identitet: Unikt mönster.
Då isolat uppvisar identiskt RFLP mönster, men med <5 band, görs även spoligotypning. Om isolaten uppvisar identiskt spoligotypningsmönster rapporteras de som tillhörande ett kluster.
Kontakt:
Provsvar: 08-457 2439
Medicinskt ansvarig: 08-457 2413
Metodfrågor: 08-457 2439 / 08-457 2431
Priser:
För aktuella priser hänvisar vi till publikationen Prislista för speciell diagnostik som finns att ladda ner på SMI:s webbplats.
Packa provet rätt:
För praktisk handledning inför transport av prov inom Sverige hänvisar vi till publikationen Packa provet rätt som finns att ladda ner på SMI:s webbplats.
Beställning av remiss:
Beställ/ladda ner SMI:s remiss
Referenser:
van Embden JD, Cave MD, Crawford JT, Dale JW, Eisenach KD, Gicquel B, Hermans P, Martin C, McAdam R, Shinnick TM, et al. Strain identification of Mycobacterium tuberculosis by DNA fingerprinting: recommendations for a standardized methodology. J Clin Microbiol. 1993;3:406-9.
Kamerbeek J, Schouls L, Kolk A, van Agterveld M, van Soolingen D, Kuijper S, Bunschoten A, Molhuizen H, Shaw R, Goyal M, van Embden J. Simultaneous detection and strain differentiation of Mycobacterium tuberculosis for diagnosis and epidemiology. J Clin Microbiol. 1997;35:907-14.
Uppdaterad 2007-08-23 12:58